基本工作原理與主要結(jié)構(gòu)和光電比色計基本相同. 圖示是一種單通道自動進樣的酶標儀工作原理圖.光源燈發(fā)出的光波經(jīng)過濾光片或單色器變成一束單色光，進入塑料微孔極中的待測標本.該單色光一部分被標本吸收，另一部分則透過標本照射到光電檢測器上，光電檢測器將這一待測標本不同而強弱不同的光信號轉(zhuǎn)換成相應的電信號.電信號經(jīng)前置放大，對數(shù)放大，模數(shù)轉(zhuǎn)換等信號處理后送入微處理器進行數(shù)據(jù)處理和計算，后由顯示器和打印機顯示結(jié)果. 微處理機還通過控制電路控制機械驅(qū)動機構(gòu)X方向和Y方向的運動來移動微孔板，從而實現(xiàn)自動進樣檢測過程.而另一些酶標儀則是采用手工移動微孔板進行檢測，因此省去了X,Y方向的機械驅(qū)動機構(gòu)和控制電路，從而使儀器更小巧，結(jié)構(gòu)也更簡單.

微孔板是一種經(jīng)事先包埋于放置待測樣本的透明塑料板，板上有多排大小均勻一致的小孔，孔內(nèi)都包埋著相應的抗原或抗體，微孔板上每個小孔可盛放零點幾毫升的溶液.

光是電磁波，波長100nm~400nm稱為紫外光，400nm~780nm之間的光可被人眼觀察到，大于780nm稱為紅外光。人們之所以能夠看到色彩，是因為光照射到物體上被物體反射回來。綠色植物之所以是綠色，是因為植物吸收的大部分為紅橙光和藍紫光，但對綠色不吸收，反射出來，所以植物呈現(xiàn)為綠色。酶標儀測定的原理是在特定波長下，檢測被測物的吸光值。

隨著檢測方式的發(fā)展，擁有多種檢測模式的單體臺式酶標儀叫做多功能酶標儀，可檢測吸光度(Abs)、熒光強度(FI)、時間分辨熒光(TRF)、熒光偏振(FP)、和化學發(fā)光(Lum)。

酶標儀從原理上可以分為光柵型酶標儀和濾光片型酶標儀。光柵型酶標儀可以截取光源波長范圍內(nèi)的任意波長，而濾光片型酶標儀則根據(jù)選配的濾光片，只能截取特定波長進行檢測。